У скрипта есть один входной файл. Как можно без пакетных файлов и командной строки сказать скрипту, что файл, который я на него перетащил, и есть входной?

Смотрите в sys.argv
Если на иконку скрипта в проводнике перетащить файл, путь к нему будет там.

Разобрался.
Скрипт у меня создавал выходной файл, но при перетаскивании он не создавался в текущей директории, как при запуске из командной строки. Грешил на проводник, а оказался, что файл создается в “C:\Documents and Settings\<им пользователя>\”