Здравствуйте!

Я хочу передавать в программу аргументы командной строки, однако когда я ввожу

ipython hello.py args

, то ipython говорит мне, что аргументы неверны, и отказывается запускаться. Как сделать, чтобы ipython воспринимал аргументы не как свои собственные, а как аргументы программы?

Заранее благодарен.

Я так понимаю, что Вы хотите видеть результаты выполнения своего скрипта в iPython и дальше с ними работать?
Если так, то просто запустите iPython и выполните:
run hello.py args

Премного благодарен. Хотя лучше было бы в одну команду.