Подскажите пример регулярного выражения для поиска словоформ например: апте(ка) ИЛИ апте(ки) ИЛИ апте(чный)?

Это не так просто. Что вы будете делать с чередующимися гласными/согласными, с модификацией корня и тд. Если нужен поиск, смотрите готовые решения (Haystack, Sphinx, Lucene).

Ну или ищите ‘апте’.

Я имею ввиду не автоматизированный подбор словоформ, a конкретно пример к данным словам апте(ка) ИЛИ апте(ки) ИЛИ апте(чный)
или как правильно?

Именно так, как вы написали: re.match(“апте(ка|ки|чный)”, “аптечный”)