решаю, что выбрать. mod_python или mod_wsgi.

mod_python - сам интерпретатор python
mod_wsgi - позволяет запускать приложения, поддерживающие WSGI интерфейс, под python

под mod_python криво работает pickle
под mod_wsgi не получается нормально просматривать ошибки скрипта

какие плюсы/минусы этих модулей вы знаете?

Вы совсем не те вещи сравниваете. Почитайте тут: http://code.google.com/p/modwsgi/wiki/FrequentlyAskedQuestions

Суть в том, что технических преимуществ у mod_python нет - только недостатки.

А про отладку тут: http://code.google.com/p/modwsgi/wiki/DebuggingTechniques

Доки рулят.