Скрипт перемещает файлы, которые могут достигать больших размеров. Т.е. процесс идёт, а пользователь ничего, кроме хруста харда, не ощущает. Как сделать индикатор прогресса перемещения? Может можно вызвать стандартное для GNOME окно “Действие над файлами”? GUI написан на wxPython.

Скрип сделать через processing (отдельным “процессом”).
А с GUI запускать процесс, по таймеру отслеживать сообщения с процесса и его (процесса) завершение.
Я таким образом решил проблему длинных тяжелых операций и неподвисающего интерфейса пользователя.

Посмотри здесь. Правда это для PyQt4, но общие принципы остаются неизменными.