def AUTO_DEL_VIRUSES(log_file):
    global LOG
    log = open(LOG, "r")
    i = 0
    for line in log.readlines():
        i += 1
        if "/" in line and i > 4:
            raw_infect_file = line.split()
            infect_file = raw_infect_file[0]
            infect = raw_infect_file[1:]
            print(line)                                                                       #До этого места все ок
            print("Удалить инфицированный файл? |", infect_file)      #Вместо этой строки, дважды выполняется следующая строка  и лишь потом эта строка.
            yes_no = input("Enter=ok|n=not|exit=exit")                     #Эта строка выполняется первее предыдущей. Что за дела?
            .....

OS: Mandriva Linux
PYTHON: 3.1
IDE: WingIDE 101
CPU: Intel i3

sys.stdout.flush()

 yes_no = input("Enter=ok|n=not|exit=exit")

print(line)                                                                                          
print("Удалить инфицированный файл? |", infect_file)