Python-сообщество

Я уже спрашивала на этом форуме о работе с базой данных:
http://python.su/forum/topic/14442/?page=1

Кратко задача такая:
Есть база данных белков, в которой порядка 11 миллионов записей. Периодически нужно делать выборки, а так же записывать в нее много данных. База данных - sqlite.
На моем домашнем компьютере запись данных (около 10 тысяч) в базу данных занимает несколько часов.
Так жить нельзя

Данные записываются примерно так:

cu.executemany("UPDATE  proteins SET taxon=?, status=? WHERE ID=?", datum)

Надеюсь индекс по полю ID создан?

Проверьте, использует ли executemany одну транзакцию. Скорее всего да, но проверить не помешает.
Вот здесь основные приемы оптимизации Sqlite описаны: http://web.utk.edu/~jplyon/sqlite/SQLite_optimization_FAQ.html

Спасибо, пойду читать

Проверьте, использует ли executemany одну транзакцию. Скорее всего да, но проверить не помешает.

Надеюсь индекс по полю ID создан?

Elka
Нет, не создан.
Пойду разбираться, как это делать.

ID PRIMARY KEY

ID INTEGER

Всем спасибо за советы!
Помогли индексация и изменение размера кеша в памяти при обновлении. К тому же нашла еще в коде ошибку, из-за которой тоже были заметные тормоза.

Ну и сколько по времени сейчас это занимает?

Порядка секунды (или меньше), точно время не засекала, но очень быстро.