Надо выполнить сингулярное разложение матрицы (из файла или клавиатуры) с помощью функции numpy.linalg.svd а затем в диагональной матрице положить наименьшие собственные значение равными 0, так чтобы сумма квадратов оставленных сингулярных значений была не меньше 90% суммы квадратов всех сингулярных значений.

Не надо нам таких выпускников. Иди в жопу.