Теперь увидел что нормально всё работает, не понимал до этого.
>>> MyModel_Author.objects.filter(mymodel_book__name__iendswith='3') [<MyModel_Author: Author 1>] >>>
Думал что при связи через ForeignKey связь в одну сторону устанавливается, только со стороны где этот самый ForeignKey есть.