Прошу прощения за, возможно, глупый вопрос.
В переменной PATH прописал пути C:\Python34 и C:\Python34\Scripts. Если скрипт лежит в C:\Python34, то import без проблем запускает его. Но если скрипт в папке C:\Python34\Scripts, то import не находит его. Подскажите в чем дело.

А он и не должен там искать. PATH - это директории с исполняемыми программами.

добавлю что можно задать переменную окружения PYTHONPATH.