sander
это просто метод save переопределить у модели?

Не надо ничего переопределять… Зачем? Что за джанговские забобоны? Вы же пишите на фласке. Тем более, что путь для файла Вы сами назначаете, т.е. часть пути у Вас уже есть. Осталось только добавить специфическую часть конкретно для этого файла и “вуаля” - все готово.

Просто в тему https://github.com/justanr/Flask-Transfer

iho
судя по примеру, расширение дублирует функционал Flask-WTF