from Tkinter import *

def func1() - определяем одну функцию
def func2() - определяем вторую функцию
def func3() - определяем 3-ю функцию

class MyClass(Frame):
    def __init__(self, master=None):
        Frame.__init__(self, master)
        self.pack({'padx':5, 'pady':5})

внутри этого класса имеются такие элементы, как флажки и переключатели



def open_myclass():
    app=MyClass(master=Tk())
    app.master.title(u'Модуль N: афигенно-сложные расчеты того-то')
    app.mainloop()

import os, sys
sys.path.append(os.path.dirname(__file__))

from module1.modules1_func import open_myclass11
from module2.modules1_func import open_myclass12


root = Tk()

root.title(u'Моя программулинка')

bar=Menu(root)

menu1 = Menu(bar)
menu1 .add_command(label=u"Отчет 1...", command=open_myclass11)
menu1 .add_command(label=u"Отчет 2...", command=open_myclass12)
...

root.config(menu=bar)
root.mainloop()

from module1.modules1_func import open_myclass11
...
menu1.add_command(label=u"Отчет 1...", command=open_myclass11)

from module2.modules1_func import open_myclass21
...

def newdef():
    print u'Запускаем форму для отчета 2'
    open_myclass21()
...

menu1.add_command(label=u"Отчет 2...", command=newdef)

import os, sys
sys.path.append(os.path.dirname(__file__))

from module1.modules1_func import open_myclass11

if __name__=='__main__': open_myclass11()

import os, sys
sys.path.append(os.path.dirname(__file__))

from module1.modules1_func import open_myclass11

def asdf():
    root=Tk()
    btn=Button(root, width=20, text=u'кнопка1')
    btn.bind('<Button-1>', lambda _: open_myclass11())
    btn.pack()
    root.mainloop()

if __name__=='__main__': asdf()