а почему вообще не ?

Если хотите посчитать корреляцию, очень желательно использовать уже встроенные формулы, также можно и визуализацию подтянуть под это дело.

Если же, хотите реализовывать все вручную, то вам гораздо быстрее все будет изобразить в том же экселе, а потом экспортировать числовой ряд в питон и заняться визуализацией .

Lainelir
Посчитать вручную без nimpy и scipy так как нимпи выдает ошибки часто а сципи не устанавливается.

Посмотрите в сторону пакета scikit-image, вполне вероятно он умеет делать то, что вы хотите.
Если у вас фотография 12 Мпикс, то вложенные циклы будут пробегать все эти 12 миллионов точек, а это очень долго на Pythonе. Использовать NumPy придется, либо Cython, наконец. Какие ошибки выдает NumPy?!