Хотел для django поюзать, а тут как раз на кафедре говорят, программист нужен. Вот и подумал, почему бы не совместить приятное с полезным. Только не знаю
Насколько питон подходит для создания физических/химических/математических программ?

всё зависит от твоего воображения :)

Очень хорошо подходит. Даже есть уже полно готовых библиотек для подобного рода вещей.

значит пошло-поехало)

Хорошо подходит. Давно использую питон вместо матлаба.

Упомяните уж numpy, scipy… Что-нибудь еще?

во сколько раз в среднем скорость программы на питоне ниже аналогичной на С++?

В среднем скорость исполнения программы никак не зависит от языка программирования. Только от кривости рук программиста.
Питон - не исключение.

Learning Python
Mark Lutz and David Ascher:

“Finally, in terms of what you may already know, people sometimes compare Python to
languages such as Perl, Tcl, and Java. While these are also useful tools to know and use, we
think Python:
• Is more powerful than Tcl, which makes it applicable to larger systems development
• Has a cleaner syntax and simpler design than Perl, which makes it more readable and
maintainable.
• Doesn't compete head-on with Java; Python is a scripting language, Java is a systems
language such as C++
Especially for programs that do more scan text files, and that might have to be read in the future
by others (or by you!), we think Python fits the bill better than any other scripting language
available today. Of course, both of your authors are card-carrying Python evangelists, so take
these comments as you may.”

Если это Вам поможет.

посоветуете начать с версии 2.6, а не с 3.1?
Книга Сузи нормальная? Какую посоветуете?