спасибо за дельные советы! буду углубляться.

Посоветовали такие вещи:
“стояла бы обработка исключений в urllib скрипт бы не вылетал при ошибке, можно попробовать или обновить питон/либы, или добавить самому исключение в свой скрипт.”
Просьба прокомментировать. Что это и куда?
и
“в практике такое случалось когда на серваке настроены
виртуальные директории и поэтому реальные пути не подходили, надо было
лезть в скрипт и менять все пути”
Что это за чудо такое, “виртуальные директории”?

ОЧЕНЬ сильно не похоже что проблема в Пайтоне. надо смотреть что за УРЛ скрипты пытается дернуть и пытаться открыть его чем-то другим. А проверка прав и т.п. больше всего напоминает “протирание лобовухи и пинание колес”.